Устранить проблему переодической перегрузки сервера на Ubuntu (хост -РуЦентр).

Имеется сайт на системе Ubuntu, хостится на Руцентре, VDS.
Периодически сайт выдает ошибку, Яндекс-Метрика присылает ошибку:

"Описание проблемы: Истекло время подключения к серверу
Возможные причины проблемы: Сервер, на котором размещен сайт, перегружен, или на нем неверно сконфигурирован файрвол"

Нужно посмотреть верно ли сконфигурирован сервер и разобраться какой из скриптов сайта...