Удалить вредоносный код с сайта

На нашей площадке антивирусом обнаружены подозрительные скрипты.
Требуется проверка, анализ и устранение уязвимостей в программном обеспечение сайта.
Скорее всего с нашего компьютера украден FTP-пароль и вирус загружен на наш сайт, либо
файлы изменены через уязвимость в скриптах одного из наших сайтов.